Acá les paso un link de un enlace sobre un How To de como montar un exchange 2003 con varios dominios en un windows 2003.
Los temas que tratan son:

Preliminares
Multiples dominios
Almacenamiento de buzones
Alta nuevos usuarios
Cambio de politicas de contraseñas en windows 2003
Iniciar el servicio POP3
Mover buzones
Administracion de Exchange
Servidor Virtual POP3
Servidor Virtual SMTP
Conector SMTP
Solucion de Problemas y varios

Este es el link: http://www.sortoson.net/estaWeb/manExchange/index.htm